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Communautés bactériennes marines et pollution microbienne

Code UE : GEM105

  • Cours + travaux pratiques
  • 5 crédits
  • Volume horaire de référence
    (+ ou - 10%) : 45 heures

Responsable(s)

Isabelle POIRIER

Ecole des transitions écologiques Par ses missions de formation, de recherche et de diffusion de la culture scientifique et technique, le Cnam est un acteur majeur de toutes les transitions : écologique, énergétique, numérique, économique, pédagogique, sociétale...
Afin d'accompagner ces transitions, l'établissement propose des écoles thématiques pour mettre en lumière les expertises et proposer une offre de formation riche et pluridisciplinaire. Le Cnam a ainsi ouvert l'École des transitions écologiques, l'École de l'énergie, l'École de la santé et l'École du numérique et de l'intelligence artificielle.

Public, conditions d’accès et prérequis

Accessible aux étudiants ayant validé 120 ECTS dans une formation scientifique supérieure et ayant de bonnes connaissances en microbiologie et biologie moléculaire.

L'avis des auditeurs

Les dernières réponses à l'enquête d'appréciation pour cet enseignement :

Objectifs pédagogiques

Présentation des communautés bactériennes des différents compartiments du milieu marin.
Présentation du rôle de ces communautés bactériennes.
Présentation de la potentialité de certaines bactéries marines dans les mécanismes de bio-remédiation.
Présentation des différentes étapes de la mise en place d’un biofilm bactérien.
Présentation du phénomène de biocorrosion.
Présentation des techniques moléculaires utilisées en écologie microbienne.
Présentation de l’utilisation de la spectrométrie de masse pour identifier rapidement des souches bactériennes marines.
 

Compétences visées

Prélever des échantillons marins en vue d'analyses microbiologiques
Conditionner et stocker ces échantillons pour assurer la fiabilité des résultats
Analyser ces échantillons au laboratoire pour dénombrer différents groupes bactériens et identifier les groupes taxonomiques dominants
Savoir appliquer les bonnes pratiques de terrain et de laboratoire
Appliquer les méthodes pasteuriennes et les outils moléculaires

Contenu

- Communautés bactériennes marines.
- Processus de bio-remédiation.
- Biofilms et Biocorrosion.
- Pollution microbienne.
- Outils moléculaires appliqués à l'écologie microbienne.
- Identification bactérienne par spectrométrie de masse.

Modalité d'évaluation

Examens théoriques ; TP/TD notés

Bibliographie

  • Stéphan Jacquet, Anne-Claire Baudoux, Yves Desdevises, Soizick F. Le Guyader : LES VIRUS MARINS Simples parasites ou acteurs majeurs des écosystèmes aquatiques ?
  • Olivier Pereira : La métagénomique pour étudier diversité et fonction des communautés microbiennes marines : un focus sur les Archaea du Marine Groupe II (MGII) - Thèse de doctorat
  • Jean-Claude BERTRAND, Pierre CAUMETTE, Philippe LEBARON, Robert MATHERON, Philippe NORMAND : Ecologie microbienne Microbiologie des milieux naturels anthropisés

Cette UE apparaît dans les diplômes et certificats suivants

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Intitulé de la formation
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Modalité(s)
Lieu(x)
Intitulé de la formation Cadre technique génie de l'environnement marin
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Lieu(x) Initial
Lieu(x) Normandie, Paris
Entrée Niveau 4 (Bac)
Intitulé de la formation Cadre technique génie de l'environnement marin
Type
Lieu(x) Package
Lieu(x) Guadeloupe
Entrée Niveau 4 (Bac)
Intitulé de la formation Type Modalité(s) Lieu(x)

Contact

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50110 Cherbourg en cotentin
Tel :02 33 88 73 40
Service scolarité
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